Il débute à Lyon dans les années 90 en fondant "le Complexe du Rire", théâtre dans lequel il crée de nombreux spectacles : "Les Amuse-Gueules", "Vertiges de l'humour", "Décalage immédiat" … qui connaissent de gros succès, en France mais aussi en Suisse, Réunion, Belgique, Québec.
Ce qui ne l'empêche pas de rencontrer la Femme de sa vie* !
Fan de Shakespeare et Molière, il joue également dans "Roméo Juliette" et "le Malade Imaginaire".

Il poursuit ensuite son parcours à Paris en jouant de nombreuses comédies :
"Un Monde Merveilleux", "Cinq minutes pas plus", "Un conseil très municipal" dans différents théâtres comme la Comédie de Paris, le Rive Gauche, le Splendid.
Un petit tour au Théâtre Daunou en septembre 2000 avec "Le printemps des bourges" et Marie Blanche

Alain Chapuis participe à quelques émissions télé à vocation humoristique telles que "Les Cerises sur le Gâteau" France 3, ainsi que des films "Un Crime au paradis", "Ben-Hur" et téléfilms "L'Eté Rouge", "Lyon Police Spéciale", "Chercheur d'héritier", "Capitaine Lawrence".

En 2003, il a été le partenaire d'Anne Roumanoff tous les dimanches soirs dans l' émission "Vivement Dimanche Prochain" animée par Michel Drucker.

Dès janvier 2005, il sera le tavernier dans Kaamelott, nouvelle série sur M6.